Institut de recherche en immunologie et en cancérologie (IRIC)

Animalerie AJMC

L’institut héberge une des plus grandes animaleries au Canada offrant un secteur exempt de pathogènes, un secteur conventionnel et une quarantaine autonome. En plus de l’hébergement et des supports technique et vétérinaire pour la recherche et la santé animale, l’animalerie de l’institut collabore avec la plateforme de biopharmacie de la Faculté de pharmacie de l’Université de Montréal pour offrir des services de pharmacocinétique, bioanalyse et toxicologie (www.pfbio.ca) .

Plateforme bio-informatique

Gamme de services d’analyse et de consultation en bio-informatique

Plateforme bio-imagerie

1. Stéréomicroscope à fluorescence LEICA MZ FLIII

2. Microscope inversé LEICA DMIRB

3. Microscope inversé DeltaVision Elite

4. Microscope Zeiss Axio-Imager Z 1

5. Microscope confocal à balayage Nikon SFC (swept field confocal microscope)

6. Microscope confocal LSM 510 META Zeiss

7. Microscope confocal Nikon A1R

8. Trois stations d’analyse d’images munies des logiciels NIS-Elements (Nikon), Metamorph (Molecular Devices), softWoRX suite (Applied Precisions), ImageJ (NIH) et IMARIS (BitPlane).

9. Le poste d’infographie est doté des logiciels Adobe Photoshop, Illustrator, InDesign et d’une imprimante couleur permettant la production de documents grand format de qualité supérieure.

Plateforme biophysique

1. 600 MHz Varian Unity Inova spectromètre

a. Quatre canaux RF capables d’exécuter des expériences de résonances multiples et multidimensionnelles avancées (jusqu’à 4D)

b. Sonde en triple résonance de 5 mm, utilisée notamment pour l’étude des biomolécules offrant une capacité de découplage 2 H

c. Sonde en bande large de 5 mm capable de détecter des noyaux de 15 N à 31 P

d. Sonde froide HCN. Idéal pour les protéines ou l’analyse de l’ARN. Il s’agit de la sonde par défaut du système 600 MHZ

2. NMR 400 MHz Système d’automatisation de Varian

a. Analyse automatisée jusqu’à 96 échantillons

b. Deux canaux RF

c. La sonde OneNMR de 5 mm pour une sensibilité accrue de 1 H et 13 C

d. Capacité de détection des noyaux de 15 N à 31 P

3. Grappe de calcul Linux comprenant quatre serveurs et six postes de travail à processeurs doubles (Opteron CPU). Variété de logiciels, y compris XPLOR, ARIA, CYANA et CNS (tous capable de fonctionner sur plusieurs CPU) et d’autres logiciels de visualisation (NMRView, NMRPipe, NMRDraw, pymol et molmol)

Fournit une solution d’avant-garde en spectroscopie par résonance magnétique nucléaire, en mettant l’accent particulièrement sur les expériences portant sur l’étude de la structure des protéines, des interactions protéine-ligand et des analyses de routine de petites molécules.

Plateforme chimie médicinale

1. Systèmes de chromatographie liquide couplés à des spectromètres de masse quadripolaire et à temps d’envol (LC/MS TOF, LC/MS Triple Quad et Simple Quad)

2. Appareils de chromatographie liquide à haute pression (HPLC) de type analytique et préparatif

3. Appareils automatisés de purification par chromatographie flash sur silice (ISCO et Biotage)

4. Fours micro-ondes incluant échantillonneur automatique pour réactions chimiques à haute température

5. La plateforme de chimie médicinale exploite une collection de plus de 20 000 réactifs commerciaux, une chimiothèque de plus de 100 000 molécules ainsi que plus de 5 000 molécules brevetées.

Offre des services aux chercheurs pour créer des outils moléculaires originaux et uniques, ou valoriser la découverte d’entités chimiques ayant un potentiel thérapeutique. L’équipe utilise les plus récentes techniques de synthèse, de purification et d’analyse de molécules.

Plateforme criblage à haut débit

1. Analyse et stockage des données

2. Station de microscopie semi-automatique

3. Système de criblage à haut contenu d’information (high-content screening) avec l’Operetta de Perkin-Elmer

4. Station de pipetage semi-automatique

5. Système robotique intégré avec station de pipetage, incubateur et lecteurs Envision (Perkin-Elmer), SpectraMaxL (Molecular Devices) et le BMG POLARstar permettant la lecture de :

a. Densité optique

b. Luminescence et luminescence accrue

c. Intensité de fluorescence normale et en temps résolu

d. Polarisation de fluorescence

e. FRET, BRET

f. AlphaScreen

g. Plaques de 96, 384 et 1536 puits

Conçue pour exécuter une variété d’essais biochimiques et cellulaires avec différents systèmes et modèles biologiques, la plateforme de criblage à haut débit a une capacité allant jusqu’à 25 000 tests par jour.

Plateforme cytométrie en flux

1. Séparateur de cellules autoMACS

2. Trieur de cellules BD FACSAria I (2 lasers)

3. Trieur de cellules BD FACSAria IIu (3 lasers)

4. Analyseur de cellules BD FACSCanto II avec carrousel (3 lasers)

5. Analyseur de cellules BD LSR II avec module HTS (3 lasers)

Mesurer et analyser différentes caractéristiques physiques de cellules ou particules entre autres pour l’immunophénotypage, l’étude du cycle cellulaire et de l’apoptose, l’analyse de prolifération cellulaire, l’analyse de cytokines intracellulaires, l’étude de voies de signalisation (phospho-protéines), la mesure du niveau d’expression de gènes avec protéines fluorescentes (GFP, YFP, etc.), la mesure du Ca2+ intracellulaire, pH intracellulaire, du FRET et ROS. Les trieurs purifient (isoler) également des sous-populations de cellules.

Plateforme génomique

1. Séquençage par capillaire

a. Séquençage d’ADN (plasmides, produits PCR, etc.)

b. Résultats en 48 h

c. Accès personnalisé à ses séquences sur un serveur sécurisé

d. Appareils : ABI 3730

2. Séquençage de nouvelle génération

a. Génome/Transcriptome

b. Exome ou régions génomiques ciblées

c. ChIP (immunoprécipitation de la chromatine)

d. Appareils : Illumina HiSeq2000 et miseq

3. PCR en temps réel (qPCR)

a. Service complet, conseils sur la stratégie à adopter

b. Préparation du cDNA

c. Conception des essais

d. Validation et analyse de vos résultats

e. Appareils : ABI 7900HT, ViiA7 et Roche LC480

4. Biopuces (Microarrays)

a. Appareil en libre-service (aucun soutien disponible)

b. Appareils : Scanner GenePix 4000B

5. Analyse de l’ADN et de l’ARN

a. Analyse de la qualité et de la quantité de l’ARN

b. Rapport complet en format PDF

c. Indice de qualité RIN pour l’ARN

d. Appareils : Agilent Bioanalyzer 2100 et NanoDrop 8000

Plateforme histologie

1. Station macro-photo: PathStand 40 Gross Dissection Imaging System (SPOT Imaging Solutions)

2. Table de nécropsie

3. Circulateur/Processeur de tissus pour la pathologie : Tissue Tek VIP 5 (Somagen)

4. Station d'enrobage paraffiné : Tissue Embedding Center EC 350 (Microm)

5. Microtomes : RM2255 (Leica) et Finesse E+ (Shandon)

6. Cryostat : CM3050S (Leica)

7. Colorateur standard : DRS601 (Somagen)

8. Immunocolorateur automatisé pour immunohistochimie, immunofluorescence et hybridation In Situ : Discovery XT (Ventana Medical Systems Inc. et Groupe Roche)

9. Modules de confection de matrices tissulaires (« tissue microarrays/TMA ») : MTA-1 et ATA-27 (Beecher)

10. Microdissecteur Laser : PALM MicroBeam (Zeiss)

11. Scanner de lames haute capacité (210 lames) des coupes en champ clair et fluorescence : NanoZoomer 2.0-HT (Hamamatsu)

12. Station d'analyse d’images : VisiomorphDP™ (Visiopharm)

13. Logiciel de télépatologie en ligne : mScope pédagogique et Aurora

Services d’histologie, d’immunohistochimie, d’acquisition d’images, de microdissection au laser et de confection de micromatrices tissulaires. Description macroscopique détaillée, numérisation des spécimens et identification des prélèvements. Analyse microscopique des tissus humains, murins et d’autres modèles expérimentaux par un pathologiste.

Plateforme protéines recombinantes et anticorps

Système de purification de protéines AKTA

Service d’expression et de purification de protéines à moyenne et grande échelle à partir d’E. coli et de cellules d’insectes et produit des anticorps polyclonaux de haute qualité. Assiste aussi les chercheurs dans l’établissement de différentes stratégies pour l’expression de protéines et la production d’anticorps.

Plateforme protéomique

1. Appareil d’électrophorèse sur gel (X-cell Surelock Minicell, Invitrogen)

2. Appareil de digestion automatique de bandes/spots d’électrophorèse sur gel (ProPre, Perkin Elmer)

3. Système de nano-chromatographie liquide sur phase inverse couplée à un spectromètre de masse hybride LTQ-Orbitrap Elite de Thermo. Le débit d’analyse sera de 600 nl/min. Limite d’identification 10 fmol injectées.

4. Identification des protéines avec la combinaison de Mascot Daemon et Mascot Distiller.

5. Profil peptidique effectué avec des logiciels développés dans notre laboratoire.

Permet l’identification de protéines contenues dans des bandes de gel 1D, de faire du profil d’expression protéique ou de l’identification ciblée de modifications post-traductionnelles (phosphorylation et glycosylation) et d’analyser les échantillons par chromatographie bidimensionnelle combinant chromatographie échangeuses d’ions et chromatographie en phase inverse.

Plateforme transgénèse

Services :

1. Microinjection d’ADN au pronoyau

2. Ciblage de gène dirigé

3. Injection de cellules ES dans les blastocystes

4. Cryopréservation d’embryons

5. Cryopréservation de spermatozoïdes

6. Laboratoire de redérivation

7. Fécondation in vitro