Centre de biologie chimique microbienne

Université McMaster, Hamilton, Ontario
Que fait l'installation

Un centre de recherche de pointe qui fournit soutien, formation et services dans les domaines de la biologie des protéines et des cellules, du criblage à haut débit, de la chimie de synthèse et de purification, de la spectrométrie de masse et de la RMN.

Domaines d'expertise

Le centre est un laboratoire unique en son genre conçu pour appuyer les chercheurs des milieux universitaire et industriel dans les domaines de la chimie et de la biologie. Il est administré par cinq employés à temps plein et compte six laboratoires intégrés appuyant une vaste gamme d'activités de recherche. Le laboratoire de criblage à haut débit se spécialise dans la découverte de médicaments et est doté d’un assortiment de 320 000 petits composés moléculaires; le laboratoire de biologie des protéines et des cellules appuie des activités de cultures mammaliennes et bactériennes, de purification protéinique et d'essais technologiques; le laboratoire de bioanalyse offre des services de protéomique, de métabolomique et de confirmation de masses haute résolution; le laboratoire de synthèse chimique est également adapté aux activités d'isolation et de purification des produits naturels; le laboratoire de RMN offre un instrument à cryosonde de 700 MHz et le laboratoire de bio-informatique fournit une panoplie de services de calculs appliqués aux sciences biologiques. 

Services de recherche

Criblage à haut débit, criblage in vitro de composés sur mesure, croissance et lyse de cellules, purification et analyse de protéines, séparations chromatographiques, protéomique, métabolomique, confirmation de masses haute résolution, interactions biomoléculaires, études cinétiques, spectrométrie, chimie médicinale, isolement de produits naturels, détermination structurale de composés chimiques organiques

Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Industrie chimique
  • Éducation
  • Technologies et services de l’environnement
  • Pêches et aquaculture
  • Soins de santé et services sociaux
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Fabrication et transformation

Laboratoire spécialisé 

Équipement

Fonction 

Laboratoire de criblage à haut débit

Robot de manipulation de liquides Biomek® FXP

Système à deux bras de pipetage équipés de têtes multi-canaux (96 et 384); avec possibilités de refroidissement des réactifs, d’agitation et de lecture de codes à barres.

 

Robot de manipulation de liquides Biomek® FXP dans une enceinte de sécurité biologique de niveau 2

Système aménagé dans une enceinte de sécurité biologique fermée munie d’un filtre HEPA; idéal pour les épreuves biologiques comprenant des agents du groupe de risque 2.

 

Robot de manipulation de liquides Biomek® FXP autonome

Système servant à la réplication de microplaques et à la distribution sur microplaques; avec tête Span-8 à huit canaux à écartement variable permettant une sélection précise.

 

Incubateurs Cytomat™ 6001

Incubateur automatisé offrant des conditions stables et uniformes de température, d’humidité et de CO2; températures d’incubation de 10 °C à 50 °C; robot de manipulation de liquides Biomek intégré.

 

Lecteur de microplaques multidétectionEnVision® 2104

Lecteur de microplaques mesurant la luminescence, la fluorescence et l’absorbance; détection AlphaScreen; avec agitation et chauffage; système à filtre et à monochromateur; intégration avec les plateformes Biomek et un appareil autonome supplémentaire avec empileurs pouvant accueillir jusqu’à 50 microplaques d'essai.

 

Distributeur de réactif BioRAPTR™ FlyingReagent Dispenser™

Distributeur automatisé sans contact pouvant ajouter jusqu’à huit réactifs sans contamination croisée; volumes de 100 nanolitres à 60 microlitres.

 

Système de stockage Cytomat™ 24

Dispositif d’entreposage à grande capacité pour microplaques et boîtes d’embouts avec robot de manipulation de liquides Biomek intégré.

 

Logiciel SAMI® Workstation EX

Logiciel permettant la programmation d’épreuves au moyen d’une interface graphique, de prévoir les épreuves en vue d’optimiser le débit et d’enregistrer les données générées pendant le fonctionnement du système.

 

Outils munis de tiges magnétiques

Outils munis de 96 ou de 384 tiges magnétiques offrant un moyen économique de transférer avec précision de faibles volumes de liquide.

 

Laveur de microplaques ELx405

Appareil offrant une vaste gamme de cycles de lavage, du lavage en douceur (tests cellulaires) au lavage vigoureux (tests ELISA).

Laboratoire de biologie cellulaire et protéinique

Autoclave de Getinge

Stérilisation à la vapeur de solides enveloppés; cycles liquides et sous vide partiel.

 

Incubateurs

Incubateurs fixes et à agitateurs de laboratoires de niveau de bisoéscurité 1 et 2 permettant l’incubation à température contrôlée, et incubateurs spécialisés dans les tâches de culture tissulaire et bactérienne.

 

Fermenteur/bioréacteur BioFlo® 115

Permet la fermentation et la culture cellulaire à grande échelle; adapté à une vaste gamme de types de cellules; système muni de dispositifs de contrôle intégrés avec contenants de 1,3 et de 7,5 litres.

 

Microscope inversé Eclipse de Nikon

Microscope utilisé pour l’examen et la quantification de cellules de cultures tissulaires.

 

Enceintes de sécurité biologique

Trois enceintes de sécurité biologique de classe II, type A2; deux pour la manipulation de bactéries, une pour la culture tissulaire.

 

Hotte AirClean

Hotte à flux laminaire pour la protection des échantillons.

 

Broyeurs cellulaires en mode continu avec adaptateur One Shot de Constant Systems

Appareils permettant le broyage cellulaire en mode continu et discontinu; traitement rapide de grands volumes de suspension cellulaire ou, avec l’adaptateur One Shot, traitement d’échantillons de petit volume avec une perte minimale; lyse de cellules en culot, en pâte ou en suspensions.

 

Broyeur cellulaire par ultrasons Microson™ (sonicateur)

Broyage cellulaire par vibration mécanique; ajustement automatique; mode continu ou pulsé.

 

Centrifugeuse haute vitesse de Sorvall

Centrifugeuse haute vitesse avec plusieurs rotors, dont un accueillant 6 tubes de 1000 millilitres et des adaptateurs pour microplaques; force centrifuge relative maximale de 70 450 g.

 

Ultracentrifugeuse de Sorvall

Ultracentrifugeuse avec force g maximale de 802 000 g; rotors à angles fixes et à godets oscillants.

 

Systèmes ÄKTApurifier et ÄKTAexplorer

Systèmes de chromatographie FPLC utilisés pour isoler des protéines à partir de mélanges complexes; chargement des échantillons par pompe, préparation de tampons, fonction de mise à l’essai et trousse 3D permettant la purification séquentielle sur colonne.

 

Lecteur de microplaques SynergyTM

Lecteur de microplaques à filtre et à monochromateur mesurant l’absorbance ainsi que l’intensité de luminescence et de fluorescence; injection automatisée des réactifs; incubation à température constante pour études cinétiques.

 

Lecteur de microplaques Ultra Evolution de Tecan

Lecteur à filtre de microplaques à 1536 puits (absorbance, fluorescence, luminescence, polarisation, fluorescence en temps différé, et mesure de la durée de vie à l'échelle de picosecondes et de nanosecondes par TCSPC).

 

Lecteur de microplaques Sunrise de Tecan

Lecteur de microplaques à 96 puits (filtre) mesurant l’absorbance et permettant le tracé de courbes de croissance.

 

Lecteurs de microplaques SpectraMax® Plus384

Lecteur d’absorbance permettant l’analyse du contenu de cuvettes ainsi que de microplaques à 96 et à 384 puits; monochromateur offrant une vaste gamme de longueurs d’onde.

 

Système de détection par résonance plasmonique de surface ProteOnMC de Bio­Rad

Système de détection de l’interaction entre deux biomolécules non marquées en temps réel; étude des interactions protéine-protéine, protéine-petite molécule et protéine-ADN; études cinétiques (vitesses d’association et de dissociation).

 

Système Typhoon

Imageur multimode (fluorescence, luminophore à mémoire et luminescence)

 

Électroporateur

Appareil servant à perméabiliser les membranes cellulaires.

 

Système de détection pour PCR en temps réel CFX96 de Bio-Rad

Système doté d’une fonction de gradient optimisant la réalisation de plusieurs réactions dans le cadre d’une même expérience et permettant de distinguer jusqu’à cinq  cibles dans un même puits de réaction.

 

Automate d'électrophorèse Experion™ de Bio-Rad

Système utilisant la technologie microfluidique LabChip pour automatiser l’électrophorèse de protéines et d’acides nucléiques; réalise en à peine 30 minutes toutes les étapes de l’électrophorèse sur gel, soit la séparation, la coloration, la décoloration, l’imagerie et l’analyse des données.

Laboratoire de bioanalyse

Spectromètre de masse micrOTOF II de Bruker à système intégré de CLHP Rapid Resolution Agilent série 1200

Spectromètre de masse à temps de vol à résolution moyenne (environ 10 000) permettant l’analyse de petites molécules et d’échantillons de plus grande taille avec une grande sensibilité; mesure exacte de la masse moléculaire aux fins de détermination de la formule moléculaire; excellent pour l'analyse métabolomique.

 

Spectromètre de masse LTQ Orbitrap XL à système intégré de CLUHP Agilent série 1290

Spectromètre haute résolution permettant l’analyse séquentielle de petites molécules ou de digestats protéiques séparés par chromatographie en phase liquide bidimensionnelle; peut servir à l’identification et à l'analyse protéique de petites molécules ou de protéines.

Laboratoire de resonance magnétique nucléaire

Spectromètre de résonance magnétique nucléaire ADVANCE III 700 MHz de Bruker

Spectromètre doté d’un passeur automatique d’échantillons (SampleJet) et d’un système de refroidissement CryoProbe permettant la RMN haute résolution du proton, du carbone, de l’azote et du phosphore à un degré de sensibilité très élevé.

Laboratoire de synthèse chimique

Système de CPL-SM ZQ2000 de Waters

Système doté de colonnes d’analyse et de préparation; détermination à 0,2 dalton près de masses pouvant atteindre 2000 daltons.

 

Système d’extraction accélérée par solvant Dionex™ 350

Système permettant l’extraction de substances chimiques à partir d’échantillons secs de plante, de biote ou de milieu (sédiments, air); solvants, temps d’extraction, température et pression programmables; cellules en acier inoxydable de tailles variées.

 

Système automatisé de chromatographie rapide sur colonne CombiFlash® Rf 200 de Teledyne Isco

Système permettant la séparation et la collecte de fractions automatisées grâce à une technologie d’identification par radiofréquence.

 

Évaporateurs rotatifs de petite et de grande taille Rotavapor de Büchi

Élimine efficacement le solvant des échantillons.

 

Synthétiseur à micro-ondes de CEM

Appareil utilisant une source d’énergie basse fréquence; amélioration de l’efficacité, du rendement et de la pureté du produit des réactions chimiques de synthèse; diminution considérable du temps de réaction; échantillonneur automatique

 

Système d’évaporation de solvants par centrifugation de Genevac.

Système haute performance d’évaporation de solvants à haut débit.

 

Plateforme de synthèse parallèle SLT100 de Chemspeed.

Système permettant l’automatisation complète de la préparation de réactifs liquides et solides, de la synthèse multiétape, du traitement conclusif, de la purification, de l’analyse et du transfert du produit vers un système de stockage; sert à la mise en place d’une chimiothèque, à l’évaluation de la solubilité, de la compatibilité et de la stabilité ainsi qu’à la préparation d’échantillons; comprend une plateforme automatisée de manipulation de liquides, un poste de pesée automatisé et un logiciel gestionnaire du flux de travail.

 

Appareil de lyophilisation

Dispositif utilisé pour lyophiliser les échantillons.

Laboratoire de bio-informatique

Services de bio-informatique

Consultation, collecte de données, extraction de données, assemblage de génomes, logiciel d’analyse de données et plateformes de traitement de données de pointe.

 

Services de conception et d’hébergement Web

Conception, développement et hébergement de sites Web, des sites de base aux sites haut de gamme hébergeant des bases de données, pour des projets à court et à long terme.

 

Analyse de données

Plateformes personnalisées d’analyse de données de criblage à haut débit; visualisation de données.

 

  • Michael DeGroote Institute for Infectious Disease Research
  • Installation de criblage de cellules souches humaines David Braley
  • Institut de recherche sur le cancer de l'Ontario

Titre

URL

Brochure du CMCB

http://iidr.mcmaster.ca/Library/IIDR_Brochure%20web.pdf

Le CMCB ouvre ses portes aux découvertes d’antibiotiques, Novembre 2012

http://iidr.mcmaster.ca/IIDR-news/CMCB_discovery.html

The Spotlight, May 2011

http://www.youtube.com/watch?feature=player_embedded&v=C_YvVenUJJs#at=15