Centre d’innovation en métabolomique (TMIC)

Université de l'Alberta, Edmonton, Alberta
Que fait l'installation

Services en métabolomique ciblés, quantitatifs et exhaustifs

Domaines d'expertise

Le centre constitue la seule source de services tarifiés de profilage métabolomique. Il s’agit de l’infrastructure la plus prestigieuse en Amérique du Nord. Notre personnel peut y réaliser diverses études de métabolomique d’avant-garde dans le cadre d’essais cliniques de recherche, d’études biomédicales, d’études de produits biologiques, de profilages de nutriments et de tests environnementaux. Ayant à sa disposition des infrastructures de métabolomique de pointe, le centre est en mesure d’identifier et de quantifier jusqu’à 2000 substances chimiques différentes à partir de certains types d’échantillons biologiques – des services près de 5 fois plus complets que tout autre service offert à l’heure actuelle. Notre expertise comprend la lipidomique et la métabolomique quantitatives, ainsi que le profilage métabolomique et lipidomique complet à l’aide de stratégies novatrices de marquage isotopique chimique. Le centre se spécialise en outre dans la métabolomique à haut débit pour effectuer des études à grande échelle. Grâce à l’accès à un vaste éventail de plateformes d’analyse, le centre est en mesure de détecter, d’identifier et de mesurer au quotidien une vaste gamme de classes chimiques et de voies métabolomiques dans des bioliquides, de la matière végétale, des échantillons environnementaux et d’autres types d’échantillons. Le centre héberge également plusieurs ressources de données de métabolomique et d’outils bio-informatiques, dont la base de données Human Metabolome et la plateforme MetaboAnalyst, qui sont mises gratuitement à la disposition de la communauté de chercheurs et chercheuses. Outre son offre de services personnalisés et de soutien bio-informatique, le centre abrite aussi des installations certifiées ISO étant en construction pour des études de métabolomique clinique.

Services de recherche

Nous offrons nos services au monde universitaire ainsi qu’à des intervenants et intervenantes du gouvernement et du secteur industriel et ce, dans nombre de domaines, dont la santé humaine, l’agriculture/agroalimentaire, l’environnement/les ressources naturelles, ainsi que la foresterie. Nous offrons des services de profilage métabolomique dans des échantillons de sérum/plasma, d’urine, de tissus, de matière fécale, de matière végétale, de nourriture, d’animaux, de cellules et d’extraits de cellules ainsi que dans plusieurs autres sortes d’échantillons.

Métabolomique et lipidomique quantitatives : Des services de spectrométrie de masse et RMN de divers types sont offerts pour effectuer des analyses ciblées de plusieurs centaines de métabolites, lipides et minéraux. Des normes étiquetées d’isotopes stables sont inclues pour les mesures absolues. Ces services permettent aux chercheurs et chercheuses de mesurer les changements dans les voies métaboliques clés comme le cycle de l'acide citrique (TCA), le métabolisme du carbone central, le métabolisme des acides gras et le métabolisme des acides aminés.

Métabolomique et lipidomique complètes : La métabolomique non ciblée s’effectue par spectrométrie de masse à haute résolution et RMN. Grâce à l’accès à de nombreuses technologies de séparation et d’introduction des échantillons, ainsi qu’à des stratégies novatrices de marquage isotopique chimique, le centre peut régulièrement détecter jusqu’à 10 000 caractéristiques et identifier de 7000 à 10 000 métabolites, en fonction du type d’échantillon. Les services de métabolomique du centre comprennent l’analyse statistique complète.

Analyse de données et bio-informatique : Ces deux services sont ouverts par l’entremise du centre. Il est possible de consulter sans frais plusieurs ressources de données au https://www.metabolomicscentre.ca/software, dont les bases de données et logiciels d’analyse de données.

Installations certifiées ISO : Le centre offre une sélection de services de métabolomique par l’entremise de ses installations certifiées ISO, dont les installations ISO 17025 à l’Université de l’Alberta et ISO 15189 pour laboratoires médicaux à l’Institut Lady Davis de l’Hôpital général juif faisant partie du Réseau Universitaire Intégré de Santé de l’Université McGill.

Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Énergie
  • Technologies et services de l’environnement
  • Pêches et aquaculture
  • Foresterie et industrie forestière
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Fabrication et transformation
  • Mines, minerais et métaux
Laboratoire spécialisé

Équipement

Fonction

Cellule Li (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse compact quadripolaire à temps de vol (Q-TOF MS) de Bruker

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution pour le profilage métabolomique non ciblé et l’identification de métabolites.

Cellule Li (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse haute définition compact quadripolaire à temps de vol (Q-TOF MS) de Bruker

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution pour le profilage métabolomique non ciblé et l’identification de métabolites.

Cellule Li (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol (Q-TOF MS) Impact II de Bruker

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution pour le profilage métabolomique non ciblé et l’identification de métabolites.

Cellule Li (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol (Q-TOF MS) Premier de Waters

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution pour le profilage métabolomique non ciblé et l’identification de métabolites.

Cellule Li (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse quadripolaire en tandem Xevo de Waters

Spectromètre de masse quadripolaire en tandem pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Harynuk (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse à temps de vol, détecteur à ionisation de flamme et chromatographe en phase gazeuse bidimensionnel complet de Leco

Spectromètre de masse à temps de vol et détection par ionisation de flamme haute résolution, couplé à un chromatographe en phase gazeuse bidimensionnel pour l’analyse de composés semi-volatils et volatils.

Cellule Overduin (Université de l’Alberta)

Spectromètre à RMN Varian 600 MHz avec autoéchantillonneur AS768

Spectromètre à résonance magnétique nucléaire (RMN) de 600 MHz pour l’identification et la quantification de métabolites solubles dans l’eau.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse 5500 QTrap de AB Sciex

Spectromètre de masse à piège à ions pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse 4000 QTrap avec ionisation par turboélectronébuliseur de AB Sciex

Spectromètre de masse à piège à ions et ionisation par électronébuliseur pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Chromatographe liquide à haute performance (détecteur UV/ionisation par désorption de champ (FD))

Chromatographe en phase liquide haute pression avec détecteur à ultraviolets et fluorescence pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Chromatographes en phase liquide ultra haute performance 1290 de Agilent (4)

Systèmes de chromatographie en phase liquide ultra haute pression pour la séparation de bioliquides complexes et autres échantillons.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètre à RMN 700 MHz de Bruker

Spectromètre à résonance magnétique nucléaire 700 MHz pour l’identification et la quantification de métabolites solubles dans l’eau.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètres de masse/chromatographes en phase gazeuse 7890A de Agilent (2)

Spectromètre de masse à chromatographe en phase gazeuse pour l’analyse de composés organiques volatils.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol (Q-TOF MS) maXis de Bruker

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution pour des analyses métabolomiques non ciblées.

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètre de masse à plasma inductif de Nexion

Spectromètre de masse à plasma inductif pour l’analyse de métaux/minéraux

Cellule Wishart (Université de l’Alberta)

Spectromètres de masse Thermo Q Exactive HF avec chromatographes en phase liquide ultra haute performance Vanquish (2)

Spectromètre de masse hybride quadripolaire à trappe orbitale avec système de chromatographie en phase liquide ultra haute pression pour un vaste éventail d’études métabolomiques.

Cellule Borchers (Université McGill/ILD-HGJ)

Spectromètres de masse QTrap 6500 (2) de AB Sciex

Spectromètre de masse à piège à ions pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Borchers (Université McGill/ILD-HGJ)

Spectromètres de masse en temps de vol triple 6600 (2) de AB Sciex

Spectromètre de masse à temps de vol pour des études métabolomiques non ciblées.

Cellule Borchers (Université McGill/ILD-HGJ)

Spectromètres de masse à chromatographe en phase liquide 6495 de Agilent (2)

Spectromètre de masse quadripolaire en tandem avec chromatographe en phase liquide pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Borchers (Université McGill/ILD-HGJ)

Système de manipulation de liquides Bravo de Agilent

Système de manipulation automatisé d’échantillons pour des études métabolomiques à haut débit.

Cellule Britz-McKibbin (Université McMaster)

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol (Q-TOF MS) couplé à l’électrophorèse capillaire (EC) de Agilent

Spectromètre de masse quadripolaire à temps de vol couplé à l’électrophorèse capillaire pour un vaste éventail d’études métabolomiques.

Cellule Britz-McKibbin (Université McMaster)

Spectromètre de masse à temps de vol couplé à l’électrophorèse capillaire (EC) de Agilent

Spectromètre de masse à temps de vol couplé à l’électrophorèse capillaire pour des analyses métabolomiques non ciblées à grande échelle.

Cellule Britz-McKibbin (Université McMaster)

Système d’électrophorèse capillaire à ultraviolets et détection à barrettes de diode (DAD) MDX de Beckman-Coulter et de Sciex

Système d’électrophorèse capillaire à ultraviolets pour la séparation hautement efficace de petites molécules.

Cellule Britz-McKibbin (Université McMaster)

Système d’électrophorèse capillaire à ultraviolets et détection à barrettes de diode (DAD) pour réseau de photodiodes (RDP) MDQ de Beckman-Coulter et de Sciex

Système d’électrophorèse capillaire pour la séparation hautement efficace de petites molécules.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Spectromètre de masse QTrap 4000 de AB Sciex

Spectromètre de masse à piège à ions pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Chromatographes en phase liquide ultra haute performance 1290  de Agilent (4)

Systèmes de chromatographie en phase liquide ultra haute pression pour la séparation de bioliquides complexes et autres échantillons.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Spectromètres de masse quadripôle en tandem 6495B de Agilent (2)

Spectromètre de masse quadripolaire en tandem pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Système de manipulation de liquides Bravo de Agilent

Système de manipulation de liquides Bravo de Agilent

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Spectromètre de masse microflex® de Bruker

Spectromètre de masse à temps de vol et désorption/ionisation laser assistée par matrice (MALDI) pour plan de travail (paillasse).

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Spectromètre de masse à désorption-ionisation laser assistée par matrice Ultraflex III temps de vol/temps de vol de Bruker

Spectromètre de masse à temps de vol haute résolution pour des études métabolomiques.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Chromatographe en phase liquide ultra haute performance UltiMate 3000 de Dionex

Systèmes de chromatographie en phase liquide ultra haute pression pour la séparation de bioliquides complexes et autres échantillons.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Système de manipulation de liquides Freedom EVO 150 de Tecan

Système de manipulation d’échantillons et de robotique pour des études métabolomiques à haut débit.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Spectromètre de masse Orbitrap Velos Pro de la famille LTQ de Thermo Scientific

 

Spectromètre de masse à piège à ions linéaire pour l’analyse haute résolution de mélanges complexes.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Spectromètre de masse Orbitrap Fusion de la famille LTQ de Thermo Scientific

Spectromètre de masse à piège à ions linéaire pour l’analyse haute résolution de mélanges complexes.

Cellule Goodlett (Université de Victoria)

Systèmes de chromatographie en phase liquide ultra haute performance Acquity de Waters (2)

Systèmes de chromatographie en phase liquide ultra haute pression pour la séparation de bioliquides complexes et autres échantillons.

Cellule Lewis (Université de Calgary)

Système de spectroscopie de masse quadripolaire en phase liquide Vanquish Q Exactive Basic de Thermo Fisher

Spectromètre de masse hybride quadripolaire à trappe orbitale haute résolution avec système de chromatographie en phase liquide Vanquish pour le profilage métabolomique non ciblé et l’identification de métabolites.

Cellule Lewis (Université de Calgary)

Système de spectroscopie de masse standard à haut fréquence quadripolaire en phase liquide Vanquish Q Exactive de Thermo Fisher

Spectromètre de masse hybride quadripolaire à trappe orbitale haute résolution avec système de chromatographie en phase liquide de pointe Vanquish pour le profilage métabolomique non ciblé et l’identification de métabolites.

Cellule Lewis (Université de Calgary)

Spectromètre de masse à quadripole à trois étages en phase liquide  Vanquish Quantum Access MAX de Thermo Fisher

Spectromètre de masse quadripolaire à trois étages couplé à un système de chromatographie en phase liquide Vanquish pour des analyses métabolomiques quantitatives et ciblées.

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  • Université de Victoria
  • Université McMaster
  • Université McGill/Institut Lady Davis de l’Hôpital général juif
  • Université de Calgary