Spectrométrie de masse par analyse protéomique et métabolomique
Le centre est l’installation centrale de protéomique et de métabolomique en activité depuis le plus longtemps au Canada. Il fournit des services en spectrométrie de masse analytique aux laboratoires universitaires, industriels et gouvernementaux depuis plus de 30 ans. Le centre a dispensé des services en protéomique et métabolomique pour plus de 2000 projets de recherche en santé, agriculture, énergie, environnement et foresterie. Le programme de développement technologique du centre soutient les projets de services et de recherche collaborative pour l’application et la mise au point de nouvelles méthodes dans l’identification et la caractérisation des biomarqueurs, la caractérisation des protéines et la bio-informatique. Le centre offre de l’expertise de haut niveau pour soutenir des projets sur mesure qui nécessitent des solutions novatrices pour répondre aux besoins en recherche de ses utilisateurs et utilisatrices.
- Protéomique quantitative non ciblée (p. ex. acquisition indépendante de données par marqueur isobare pour la quantification relative et absolue (iTRAQ) et sans marqueur);
- Protéomique quantitative ciblée fournissant une concentration absolue;
- Métabolomique non ciblée détectant plus de 5000 caractéristiques métabolitiques;
- Métabolomique ciblée utilisant plus de 30 essais spécifiques sur les classes ou voies métaboliques pour plus de 1100 métabolites;
- Caractérisation des protéines incluant l’échange hydrogène-deutérium, la réticulation des protéines, les modifications des surfaces, la caractérisation des modifications post-translationnelles;
- Services bio-informatiques et statistiques pour soutenir la conception expérimentale ainsi que l’interprétation et la visualisation des données.
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Industrie chimique
- Énergie
- Technologies et services de l’environnement
- Pêches et aquaculture
- Foresterie et industrie forestière
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
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Équipement |
Fonction |
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Spectromètres de masse à triple quadripôle (6490/6495B) d’Agilent (4) |
Protéomique (surveillance de réactions multiples) ciblée |
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Spectromètre de masse Thermo Scientific, modèle Orbitrap (Velos Pro et Fusion) |
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Spectromètre de masse couplant la désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice (MALDI) à la spectrométrie de masse à temps de vol, modèle Ultraflex III de Bruker |
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Système de manipulation des liquides de Tecan |
Traitement automatisé des échantillons |
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Plateforme de manipulation des liquides Bravo d’Agilent |
Traitement automatisé des échantillons |
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Synthétiseur de peptides, modèle SYRO II de Biotage |
Synthèse des peptides à haut débit |
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Système de chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse à simple quadripole d’Agilent
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Purification de peptides |