Recherche et prestation de services en génomique et en biologie moléculaire.
Établi en 1998, le Centre de génomique appliquée (TCAG) se consacre à la recherche innovatrice en génomique et à sa promotion, en offrant notamment des services et du soutien à la formation aux scientifiques universitaires, gouvernementaux et privés du monde entier. Chaque année, le centre mène des études expérimentales et des analyses de données pour plus de 800 clients chercheurs, provenant de toutes les provinces canadiennes et de 44 pays étrangers. Il offre des services dans les domaines de l’informatique, du séquençage, de l’analyse génétique, de la cytogénomique, de la mise en banque de matériel biologique et de l’analyse statistique, ainsi que des services de consultation et de soutien en conception et en réalisation de projets.
Séquençage, bioinformatique, génotypage, microréseaux, cytogénomique, mise en banque de matériel biologique, préparation génomique de l’ADN, calcul de haute performance, création de bases de données, analyse statistiques, consultation en matière de projets.
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Soins de santé et services sociaux
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
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Laboratoire spécialisé |
Équipement |
Fonction |
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Installation de séquençage |
Système NovaSeq 6000 d’Illumina |
Séquenceurs d’ADN à haut débit (« de nouvelle génération »). Diverses utilisations, dont le séquençage complet de l’exome et du génome, la recherche métagénomique, le séquençage d’amplicons et de régions cibles, le séquençage de l’ADN ayant subi une immunoprécipitation ou une méthylation, le séquençage génomique d’agents pathogènes et de petits organismes, le séquençage du transcriptome et autres. |
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Installation de séquençage |
Système MiSeq d’Illumina |
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Installation de séquençage |
Système Sequel IIe de PacBio |
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Installation de séquençage |
Système PromethION d’Oxford Nanopore |
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Installation de microréseaux et de génotypage |
Système de numérisation GeneChip Scanner 3000 7G d’Affymetrix |
Systèmes de microréseaux pour l’analyse complète ou ciblée du génome pour en évaluer la variabilité génétique, ainsi que pour l’analyse de l’expression génétique. |
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Installation de microréseaux et de génotypage |
Système de numérisation iScan d’Illumina |
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Installation de cytogénomique |
Microscope de marque Olympus avec le logiciel ASI |
Pour faire des analyses chromosomiques, notamment l’hybridation in situ en fluorescence de l’interphase ou de la métaphase en deux, trois et quatre couleurs, le caryotype standard en bandes G (GTG), l’analyse des chromosomes d’organismes modèles ou de cellules souches et le caryotype du cancer. |
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Installation de cytogénomique |
Microscope de marque Zeiss avec logiciel MetaSystems |
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Installation de mise en banque de matériel biologique |
Équipement de mise en banque de matériel biologique |
Hottes à flux laminaire et incubateurs de culture cellulaire pour la culture et la mise en banque de sang humain (lymphoblaste), de fibroblastes, de lignées cellulaires permanentes, de cellules souches et de cellules non humaines pour les besoins de la recherche. |
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Installation d’informatique et d’analyse statistique |
Architecture de stockage données et grappe de calcul
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Utilisée pour le traitement parallèle d’ensembles de données sur le génome entier, notamment des données sur la séquence complète de l’exome et du génome, ainsi que des données sur l’expression génétique ou le polymorphisme des microréseaux du génome entier, de même que pour l’analyse des réseaux ou des voies et l’analyse des statistiques en génétique et en épidémiologie. |
Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- DNA Genotek Inc.
- DNAstack
Information additionnelle
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Titre |
Hyperlien |
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Nouvelles archivées - TCAG. |
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Des scientifiques cartographient le génome du castor pour le 150e anniversaire du Canada. |
https://www.ctvnews.ca/health/scientists-map-beaver-genome-as-gift-for-canada-s-150th-birthday-1.32… |
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Illumina soutient l'initiative nationale canadienne de séquençage du génome COVID-19. |
https://www.prnewswire.com/news-releases/illumina-supports-canadas-nationwide-covid-19-genome-seque… |
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Une percée dans la recherche sur le spectre autistique révèle que les "rides" génétiques de l'ADN pourraient en être la cause. |
https://www.ctvnews.ca/health/breakthrough-in-autism-spectrum-research-finds-genetic-wrinkles-in-dn… |