Centre des sciences génomiques Michael Smith du Canada

Université de la Colombie-Britannique, Vancouver, Colombie-Britannique
Que fait l'installation

L’installation abrite des experts et expertes de renommée mondiale dans le domaine de la recherche en génomique et en bioinformatique, avec trente ans d’expérience à diriger et à soutenir les innovations scientifiques.

Domaines d'expertise

Le Centre des sciences génomiques Michael Smith du Canada de l’Agence du cancer de la Colombie-Britannique offre des services en génomique, en transcriptomique, en protéomique, en épigénomique, en métagénomique et en bioinformatique. Ces services sont mis en application dans des travaux de recherche sur le cancer et dans d'autres domaines de la santé, ainsi qu’en recherche clinique et dans les sciences de la vie au sens large. . Notre mandat consiste à faire progresser les connaissances sur le cancer et d’autres maladies, à améliorer la santé humaine par la prévention des maladies, à élaborer des approches diagnostiques et thérapeutiques et à rendre compte des retombées sociales et économiques de la recherche en génomique. Pour ce faire, nos scientifiques utilisent des plateformes de séquençage et des outils informatiques de pointe pour recueillir, extraire et analyser les données génomiques. Nos installations ultramodernes nous permettent d'utiliser les progrès technologiques pour le traitement d'échantillons biologiques complexes et précieux.

Le centre est unique puisqu'il favorise une collaboration étroite entre les scientifiques et les cliniciens, ce qui permet une concentration sur la recherche translationnelle directe. Grâce au programme d’oncogénomique personnalisée, le centre recourt à des technologies de séquençage pour influencer en temps réel les stratégies thérapeutiques et de gestion des patients atteints de cancer. L'installation de recherche abrite également le Centre de génomique clinique accrédité par le Collège des pathologistes américains pour effectuer des tests génomiques cliniques. Il met en outre son expertise à d’autres fins en lien avec les sciences de la vie et l’environnement, notamment la biodiversité, l'agriculture, la pêche, les sciences des aliments, l'océanographie et l'exploitation minière.

Services de recherche
  • Services d’extraction d’acides nucléiques et de mise sur pied de banques, y compris pour le génome FFPE, le génome sans PCR, l’ADN à faible taux d’entrée, le bisulfite, l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), l’ARN messager (spécifique au brin), l’appauvrissement en ribosomes, le miARN, le TCR/BCR, la capture des exomes et la capture personnalisée et 16S/ITS.
  • Les services de séquençage comprennent le génome entier, le transcriptome entier (appauvri en ribosomes, ou ARN polyA), l’épigénome, le ChIP, la capture des exomes (exons seulement ou avec les régions non traduites), le miARN, les lectures longues et les lectures liées.
  • Les services de bio‑informatique comprennent l’analyse somatique, l’immunogénétique du cancer, l’analyse épigénétique, l’analyse des variantes structurelles, l’analyse de l’expression, l’analyse germinale et l’assemblage génomique.
Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Éducation
  • Technologies et services de l’environnement
  • Pêches et aquaculture
  • Foresterie et industrie forestière
  • Soins de santé et services sociaux
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Mines, minerais et métaux
  • Industrie océanologique
  • Services professionnels et techniques (y compris les services juridiques, l’architecture et le génie)
Laboratoire spécialiséÉquipementFonction
Séquençage de l’ADNSystème de séquençage NextSeq2000 de IlluminaSéquençage d’ADN et d’ARN.
Séquençage de l’ADNSystème de séquençage MiSeq de IlluminaSéquençage d’ADN et d’ARN.
Séquençage de l’ADNSéquenceur Nanopore MinION de OxfordSéquençage d’ADN et d’ARN.
Séquençage de l’ADNSéquençeur Nanopore PromethION de OxfordSéquençage d’ADN et d’ARN.
Séquençage de l’ADNSystème de séquençage NovaSeq 6000 de IlluminaSéquençage d’ADN et d’ARN.
Séquençage de l’ADNSystème de séquençage NovaSeq X Plus de IlluminaSéquençage d’ADN et d’ARN.
Séquençage de l’ADNSystème de séquençage Revio de PacBioSéquençage d’ADN et d’ARN.
Gestion et analyse des donnéesServeur

Stockage des données : > 14 PB

Traitement des données : > 25 000 grappes

  • Agence de lutte contre le cancer de la Colombie-Britannique
  • Centre de lutte contre la maladie de la Colombie-Britannique
  • Hôpital pour enfants malades
  • Leidos Inc.
  • Coastal Genomics Inc.
  • Institut de recherche Terry Fox
  • Institut national du cancer
  • CanSeq150
  • CGEn
TitreHyperlien
Le programme d’oncogénomique personnalisée.https://www.personalizedoncogenomics.org/
Centre de génomique clinique.http://www.ccgenomics.ca/