Isolement de pathogènes, caractérisation des souches bactériennes (c.-à-d. typage moléculaire) et identification bactérienne.
Les principaux objectifs du Service de référence sur la listériose (SRL) comprennent l'enquête sur les cas de listériose et le maintien d'une collection nationale d'isolats. Le SRL héberge une base de données épidémiologique moléculaire complète de tous les isolats au Canada qui peut être utilisée comme ressource pour les enquêtes sur les éclosions, la recherche et d'autres enquêtes microbiologiques. Des profils moléculaires (séquençage du génome entier, système MALDI-TOF de Bruker) et des analyses bioinformatiques sont en cours d'établissement et de stockage pour les souches cliniques, alimentaires, environnementales et éventuellement animales de l'espèce Listeria ainsi que pour d'autres agents pathogènes d'origine alimentaire et humaine. Le SRL poursuit des activités de recherche pour l'investigation et la mise en œuvre d'autres méthodes moléculaires de caractérisation des isolats de L. monocytogenes.
Le SRL participe à PulseNet Canada pour la surveillance moléculaire en temps réel de la listériose et utilise le séquençage du génome entier combiné à la bioinformatique pour les enquêtes sur les éclosions. Les données épidémiologiques moléculaires, la coordination et l'échange d'informations en temps opportun contribuent à réduire l'incidence de la listériose au Canada.
- Aider les médecins et les ministères provinciaux de la santé lorsque des cas de listériose d’origine alimentaire sont soupçonnés
- Examiner les échantillons cliniques, environnementaux et alimentaires soumis pour analyse
- Alerter rapidement les organismes responsables lorsque des aliments du commerce sont mis en cause
- Maintenir des cultures de référence de Listeriae
- Assurer la liaison avec les centres au Canada et à l’étranger dont les intérêts et les responsabilités sont similaires
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
| Équipement | Fonction |
|---|---|
| Système MALDI-TOF de Bruker | Spectrométrie de masse à désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice à mesure de temps de vol (MALDI-TOF) pour l'identification microbienne. |
| Système OmniLog PM de Biolog | Plateforme de microréseau phenotype (PM). Identification et caractérisation microbienne. |
| Système TapeStation de Agilent | Électrophorèse automatisée pour le contrôle de la qualité de l'ADN et de l'ARN. |
| Fluoromètre Qubit Flex | Mesure de l'ADN, de l'ARN, du microARN et des protéines. |
| Séquenceur MiSeq de Illumina | Séquençage du génome entier. |
| Séquenceur iSeq 100 de Illumina | Séquençage du génome entier. |
| Séquenceur Nanopore MinION de Oxford | Séquençage du génome entier. |
| Ordinateurs/portables à haute puissance de calcul | Bioinformatique et analyse des données. |