Centre d’analyse de l’évolution et de la fonction génomique

Université de Toronto, Toronto, Ontario
Que fait l'installation

Promouvoir et appuyer la recherche interdisciplinaire appliquée aux analyses comparatives, évolutionnistes et fonctionnelles des génomes et des protéomes

Domaines d'expertise

Le centre offre des services complets de conception expérimentale, de recherche et d’analyse des génomes, des transcriptomes, des microbiomes et des protéomes. Notre installation de pointe et notre personnel technique formé à la bio-informatique offrent un vaste éventail de services de génomique, de protéomique et de bio-informatique, incluant des analyses standards et des techniques mises au point par notre équipe. Notre expertise porte en particulier sur les systèmes microbiens, végétaux et environnementaux.

Services de recherche
  • Séquençage de génome entier
  • Analyse génomique
  • Détection de polymorphismes de nucléotide simple
  • Analyse du transcriptome
  • Analyse de petites molécules d’ARN
  • Essais par immunoprécipitation à la chromatine
  • Séquençage de microbiome
  • Métagénomique
  • Métatranscriptomique
  • Détermination du poids moléculaire des protéines
  • Identification protéique
  • Détermination des modifications posttraductionnelles protéiques
  • Essais d’affinité protéinique à froid
  • Études d’identification de partenaires de purification par affinité protéique
  • Profilage protéomique détaillé d’organismes
  • Services de bio-informatique
Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Pêches et aquaculture
  • Foresterie et industrie forestière
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Mines, minerais et métaux
  • Industrie océanologique

Nom de l’équipement

Résumé de la fonction

Séquenceur de bureau NextSeq 500 v2 Illumina

Séquençage de génome entier, séquençage d’ARN, séquençage d’exome, métagénomique, métatranscriptomique

Séquenceur portable MiSeq v2 Illumina

Séquençage de microbiome, séquençage d’amplicon à haut débit, séquençage de petites molécules d’ARN, essais par immunoprécipitation à la chromatine

Spectromètre de masse hybride à piège à ions LTQ XL OrbitrapMC

Dépistage de modifications posttraductionnelles protéiques

Système EASY-nano LCMC 1200 Thermo Scientific

Dépistage de modifications posttraductionnelles protéiques

MinION et PromethION Oxford Nanopore

Séquençage de génome à lecture longue

  • Agriculture et Agroalimentaire Canada
  • Santé publique Ontario
  • Vineland Research & Innovation Centre